카드에서 몬스터로 변신하는 신비한 생명체인 카비온과 인간이 함께 공존하며 살고 있는 세상에서 벌어지는 이야기이다. 평화로운 공존의 시기가 지나가고 카비온을 흑화 시켜 세상을 정복하려는 블랙단이 나타나면서 세상은 위험에 처하게 된다. 하지만, 카비온과 교감하여 컨트롤할 수 있는 마스터들이 나타나 블랙단과 맞서 싸우게 되고, 인류는 카비온 마스터를 양성하는...