이야기는 한 소녀의 도주 장면에서 시작된다. 적의 군용 헬기에서 그 소녀를 구한 것은 평화유지 활동을 하고 있는 비밀 조직 '미스릴'소속 중사 사가라 소스케. 암 슬레이브라는 인간형 이족보행 병기 'M9(건즈 백)'에 탑승한 군인이었다. 구출한 그 소녀는 '위스퍼드(속삭임을 듣는 자)'로, 존재하지 않는 기술 '블랙 테크놀로지'를 가지고 있는 인간이었다...